非淋菌性尿道炎用药后仍然疼，可能由这些原因导致。其一，病原体对所用药物耐药，支原体、衣原体等未被有效抑制，尿道炎症持续刺激黏膜引发疼痛；其二，药物存在尿道黏膜刺激作用，用药后加重局部不适；其三，合并淋菌、真菌等其他病原体感染，单一药物未覆盖全部感染源；其四，治疗期间未做好护理，如憋尿、局部清洁不到位、摄入辛辣刺激食物等，致使炎症反复难愈。

出现这种情况需及时复诊，通过检查明确疼痛根源后调整方案。日常要保证每日饮水1500-1800毫升，多排尿冲刷尿道；保持会阴部清洁干燥，勤换内衣；饮食忌辛辣刺激，规律作息。身体恢复需要过程，不必过度焦虑，配合诊疗与护理，症状会逐步缓解。