痔疮手术两个月了大便后肛门还疼可能是伤口还没有完全愈合或是肛裂等导致的，具体如下：

1、伤口还没有完全愈合：痔疮手术两个月了大便后肛门还疼，有可能是因为伤口还没有完全愈合，这种情况一般和大便偏硬有关系，当患者大便硬结的时候，就有可能导致排便时肛门疼痛或是出血的情况。此时应该及时去医院复查伤口，坚持每天换药，促进伤口的愈合。

2、肛裂：有些病人在进行痔疮手术切除时，切除的范围过广，有可能会导致肛门狭窄，当大便经过狭窄的肛门时，可能将肛门的局部撑裂，从而导致继发性肛裂，引发疼痛和出血。患者可以在医生的指导下使用红霉素软膏、复方角菜酸酯乳膏等进行治疗。