咖啡斑里有好多黑点可能与护理不当、遗传、老年斑、太田痣、良性黑色素瘤等有关，建议通过一般治疗或激光手术来改善。

1、护理不当：若患者长时间暴露在阳光下，皮肤会受到刺激或损伤，使咖啡斑中出现黑点，建议患者注意防晒。

2、遗传：由于遗传原因，皮肤更容易产生咖啡斑，若面积较大，数量较多，里面会有黑色的小点，建议患者不要太担心。

3、老年斑：多发于中老年人，皮肤上会出现棕色或黑色的斑点，也可能有黑点分布。建议患者规律作息，清淡饮食，使用温和的护肤品。

4、太田痣：是一种常见的色素性皮肤病，通常呈片状分布，颜色由浅棕色到深棕色不等，其中可能包含许多黑点。如果影响美观，建议采取激光手术，通过光热能量将黑色素瓦解。

5、良性黑色素瘤：皮肤上会出现黑色或棕色斑点，其中可能包含黑点。建议患者及时到医院皮肤科就诊，完善检查，如有恶变的风险，可采取手术切除。

若有明显异常，建议尽快就医。